Bioinformatics Research Specialist

Acerca de Gramian

Gramian Consultancy es una consultora boutique especializada en servicios profesionales de IT y soluciones de talento en ingeniería. Con una sólida experiencia en ingeniería de software y liderazgo, ayudamos a las empresas a construir equipos de alto rendimiento al conectarlas con profesionales que se adaptan verdaderamente a sus necesidades.

Acerca del Rol

Buscamos un Especialista en Bioinformática y Genómica Computacional para diseñar tareas científicas desafiantes y realistas, junto con soluciones de referencia, para un proyecto de benchmarking de IA. Crearás flujos de trabajo genómicos de múltiples pasos que requerirán que agentes de IA interpreten datos biológicos, escriban y ejecuten código Python, utilicen herramientas computacionales, solucionen problemas de resultados intermedios y produzcan resultados científicamente válidos y objetivamente verificables. El rol es ideal para alguien con experiencia avanzada en bioinformática, biología computacional, genómica o genética computacional, combinado con sólidas habilidades de programación en Python y experiencia práctica trabajando con conjuntos de datos biológicos.

Ambiente de Trabajo

Entorno computacional aislado y reproducible basado en Python con herramientas y bibliotecas de bioinformática.

Responsabilidades Clave

• Diseñar tareas novedosas y desafiantes en genómica computacional y bioinformática que pongan a prueba las capacidades avanzadas de los agentes de IA.
• Desarrollar flujos de trabajo realistas de múltiples pasos que involucren conjuntos de datos biológicos como FASTA/FASTQ, VCF, BAM/SAM, BED, TSV/CSV, datos de expresión y anotaciones de secuencias.
• Crear tareas que requieran juicio científico, incluyendo la identificación de artefactos de datos, el manejo de la ambigüedad, la selección de métodos apropiados y la revisión de suposiciones basadas en resultados intermedios.
• Preparar especificaciones de tareas claras, conjuntos de datos de entrada, esquemas de salida esperados y verdades fundamentales objetivamente verificables.
• Desarrollar soluciones de referencia expertas y flujos de trabajo computacionales reproducibles utilizando Python, herramientas de línea de comandos y bibliotecas de bioinformática.
• Validar que las tareas sean científicamente precisas, resolubles a partir de la información proporcionada y suficientemente desafiantes para modelos de IA avanzados.
• Diseñar criterios de calificación robustos que distingan las soluciones científicamente correctas de las salidas superficialmente plausibles.
• Asegurar que los entregables sean reproducibles, bien documentados y adecuados para la revisión del cliente.
• Incorporar la retroalimentación del revisor manteniendo altos estándares de calidad y rendimiento.
• Comunicar el progreso, los bloqueos y los requisitos científicos o técnicos a los líderes del proyecto y revisores.

Requisitos

• Doctorado (Ph.D.), experiencia postdoctoral o experiencia de investigación equivalente en Bioinformática, Biología Computacional, Genómica, Genética Computacional o una disciplina estrechamente relacionada.
• Sólida experiencia práctica en programación con Python.
• Experiencia práctica en el análisis de datos de secuencias biológicas o genómicas.
• Experiencia trabajando en entornos computacionales Linux o de línea de comandos.
• Capacidad para validar de forma independiente el razonamiento científico, los métodos computacionales y los resultados analíticos.